Es el segundo de tres hermanos nacidos del matrimonio entre José Antonio Balaguer Fuertes, oficial de los cuerpos castrenses, y Lucía Elvira Coste Pantaleón, educadora graduada en pedagogía y matemáticas. Sus hermanos son Arturo José y Walkiria Josefina. Es padre de 3 hijos (Daniel, Jehu y Amy Balaguer) y esposo de Ninoska Rodriguez.

Como político ha ocupado diferentes posiciones en el PRSC, de las que se destacan, Asesor Técnico de Candidatos a la Presidencia, Miembro de la Comisión Política, Vicesecretario de Energía y Minas, Miembro del Gabinete Técnico, y Secretario de Organización (Actualmente). En el año 2016 participó en las elecciones nacionales como candidato a diputado para el periodo 2016-2020 por la circunscripción 1 de Santo Domingo Este. A pesar de no resultar electo, Balaguer obtuvo notables resultados en beneficio del partido reformista, llevándolo a un crecimiento superior al 500% en esta importante demarcación del Gran Santo Domingo.

El Ingeniero José Balaguer es Presidente y CEO de SSS Group, empresa que fundó en 2006 y que se dedica a la integración de soluciones de tecnología, diseño e ingeniería que provee a los mercados de energía, automatización y control, telecomunicaciones e hidrometeorología en República Dominicana y la región del Caribe.

En 1997 obtuvo el título de Ingeniero Electrónico en Telecomunicaciones en la Universidad APEC y posteriormente realizó estudios de especialización entre los que destacan: Maestría en Gerencia de Proyectos en la Universidad Pedro Henríquez Ureña (UNPHU). Maestría en Ingeniería Eléctrica Mención Electrónica de Comunicaciones con la Universidad De Puerto Rico Recinto Mayagüez/UNAPEC. Master en Administración de Negocios para Ejecutivos de Alto Nivel con la Universidad de Quebec Canadá (UQUAM). Especialidad en Operación y Control de Sistemas Eléctricos de potencia en KTH Royal Institute of Technology, Estocolmo (Suecia).

Ha servido al país ocupando diversas posiciones de dirección en la Empresa de Transmisión Eléctrica Dominicana (ETED), como asesor en áreas técnicas de la CDEEE y como parte de la Gerencia de Radiodifusión en el Instituto Dominicano de las Telecomunicaciones (INDOTEL). Además, fue catedrático universitario en UNAPEC y como miembro del comité responsable de la revisión de los programas e innovaciones en las carreras de ingeniería de dicha institución académica.